健康小屋體檢中心的定位是其建設和發展的前提。我國早期出現和現在運行的絕大部分健康小屋體檢中心，是以健康檢測為主營，從定位上講還停留在健康服務的初級階段，以發現疾病和對健康狀況的評估為業務定位，與各級醫院的疾病診斷有相當的重合性，對疾病的預防作用有限。
政府提出的“關卡前移、重心下移”的號召就是要突出以預防為主、從源頭治理疾病發生，全面提升居民的健康素養和健康水平。舉辦健康小屋體檢中心應該響應國家號召，迎合社會需求，從以疾病診治為中心向預防疾病為中心轉變，由單純健康體檢向健康管理過度，這是完善醫院功能，滿足向上開展疾病預防和向下做好體檢后服務的需要。
